Конформационный анализ цембрена

Цембрен -- дитерпен с 14-членным макроциклом, содержащим три транс- и 1 цис-двойные связи. [Воробьев А.В., Сальников Г.Е., Шакиров М.М., Ралдугин В.А. ХПС, 1990, 455]

Конформационный анализ проводился ...
Окончательный расчет проводился методом DFT (программа "Природа", функционал PBE, базис L1 (аналог cc-pVDZ)).

Диаграмма энергетических уровней конформеров цембрена

По клику на уровень запускается ява-апплет Jmol, показывающий трехмерную структуру, которую можно рассмотреть со всех сторон и померить расстояния и углы (для этого, возможно, потребуется установить Sun'овскую яву). Рекомендуется использовать браузер Firefox.

Проценты в надписях уровней - это относительное содержание конформеров, вычисленное по рассчитанным энергиям в соответствии с распределением Больцмана при 25 °С.

Структуры экспериментального (из приведенной выше ссылки)
и наиболее стабильного из найденных конформеров (01).

Следующие два конформера (02 и 03) отличаются только поворотом изопропильной группы. Общая доля 01+02+03 составляет 97.4%.

Таким образом, имеется полное согласие расчетов и эксперимента.

См. также конформационный анализ изоцемброла

© Сделано сотрудниками ЛИМОР при поддержке РФФИ (грант 13-03-00427a).
Представленные здесь материалы можно свободно использовать в учебно-познавательных целях