Здесь представлены некоторые программы, разработанные нами и используемые для подготовки и обработки результатов квантово-химических расчетов.

В большинстве случаев это скрипты на Perl'е. Значит, для их использования нужен Perl. На linux-системах он, скорее всего, уже есть, на Windows, вероятно, его нужно поставить (рекомендуем ActivePerl). Это бесплатно и не требует регистрации. Вес дистрибутива около 25М.

Все скрипты на опцию -h выдают help.
Их можно скачать одним архивом (~ 0.2M).

Скрипты используют формат молекул xyz. Это очень простой формат, его понимают практически все квантово-химические вьюверы (мы используем molden). В описаниях скриптов этот формат часто называется молденовским.

Описание формата xyz
1-я строка: целое число, количество атомов молекулы, и ничего более
2-я строка: вообще, она для коментариев, но многие программы, и наши скрипты тоже, первое число, встретившееся в этой строке, воспринимают как энергию.
Далее строки по одной на атом, каждая состоит из 4-х полей:
химический символ атома, декартовы координаты x, y, z в ангстремах; 5-е поле, если оно есть, будет трактоваться скриптами как хим. сдвиг.

Потом все повторяется для новых молекул (без пустых строк между ними).

Пример:

 4
 Energy -114.42514408   H2CO  Symmetry C2v    ppm
 C    0.00000000   0.00000000   0.00171470  196.6914
 O    0.00000000   0.00000000   1.20764898
 H    0.94265994   0.00000000  -0.60468184   10.4554
 H   -0.94265994   0.00000000  -0.60468184   10.4554

© Если не указано особо, то представленные здесь скрипты/программы можно брать и свободно использовать, изменять (если изменение касается фунционалитета, просьба сообщить об этом) или размещать на других сайтах (со ссылкой на этот сайт).

Если Вы планируете привести ссылку на страничку этого сайта в научной статье и не хотите, чтобы эта ссылка стала "битой" при последующих возможных перестройках сайта, сообщите нам.