Лаборатория изучения механизмов органических реакций

freq2xyz

Usage: freq2xyz [options] file.freq

Dependencies: perl

Анимация колебаний.

file.freq - файл с колебаниями в molden-формате
           Файлы в таком формате могут быть созданы квантовохимическим
           визуализатором molden (Write--Molden format), 
           программой openbabel (babel file.ext -omolden file.freq), 
           либо из расчета Природой скриптом pri2mol.

-v=%d      Номер колебания, которое нужно анимировать. Default -v=1
-n=%d      Число точек (кратное 4). Default -n=20
-f=%d      Фактор, определяющий размах колебания. Default -f=1
           
В результате генерируются конкатенированный xyz-файл (n точек) file.v.xyz,
в имени которого v - номер колебания.
В особых случаях, при -n=1 и -n=-1, генерируется xyz-файл, состоящий их 
единственной геометрии, соответствующей смещению по колебанию в прямом и
в обратном направлении.