Новосибирский институт органической химии им. Н.Н. Ворожцова СО РАН

Лаборатория изучения механизмов органических реакций

priIR

Usage: priIR [options] file [files]

Dependencies: perl, [gnuplot]


ИК-спектр из расчетов.

Из выдач расчетных программ извлекается ИК-частоты и интенсивности,
превращаются в спектр, который рисует gnuplot. Если gnuplot отсутствует, 
то спектр записывается в file.dx формата JCAMP-DX.

Форматы расчетных программ определяются автоматически.
Пока это out'ы Природы (версий 2, 6) и GAMESS US, файлы molden (*.freq).

Опции (после = указаны умолчаемые значения):
-maxfreq=4000  Левый край спектра (cm-1)
-minfreq=20    Правый край спектра (cm-1)
-linewidth=10  Ширина линии на половине высоты (cm-1)
-points=10     Количество точек спектра на ширину линии (шаг спектра
               linewidth/points округлится так, чтобы  быть делителем 10).
-lineshape=lorentz  Форма линии, lorentz либо gauss (гауссова линия уже),
                    либо палками, если что-то другое

Для gnuplot:
-terminal=x11  Терминал для gnuplot. Если терминал - файловый формат 
               (f.e. postscript), то перенаправить в файл.
               Список терминалов: echo 'help set terminal' | gnuplot
-label         Помечать частоты колебаний (не вершины пиков!)
-level=80      Уровень процента пропускания, выше которого не помечать частоты
-yaxis         Рисовать ось с процентом пропускания (%T).

-jcamp         На каждый спектр делать JCAMP-DX (файл с расширением .dx).
               -terminal=null, если не нужен рисунок от gnuplot.


  
Последняя модификация: Mon Nov 30 17:58:00 2009

Download

Source