Новосибирский институт органической химии им. Н.Н. Ворожцова СО РАН

Лаборатория изучения механизмов органических реакций

reorient

Usage: ./reorient [-ijk=i,j,k [-b]] file.xyz [> reoriented_file.xyz]

Dependencies: Perl

Переориентирует xyz-файл(ы), зануляя 6 x,y,z-координат у выбранных атомов.
После опции -ijk нужно перечислить три номера атомов, координаты которых
следует занулить. Зануляются следующие координаты:
      x     y     z
 i:  0.00  0.00  0.00    Атом i в центре координат
 j:        0.00  0.00    Атом j на оси x
 k:              0.00    Атом k в плоскости xy
Если опция -ijk отсутствует, то предполагается -ijk=1,2,3.

Опция -b означает, что тройка i,j,k будет передвинута в начало.

  
Последняя модификация: Thu Jul 2 14:23:05 2009

Download

Source