Лаборатория изучения механизмов органических реакций

mgp2xyz

Usage: mgp2xyz file.sum

Dependencies: perl

Окучивает для молдена результаты AIMAll (http://aim.tkgristmill.com).
Понимает sum- и mgp-файлы (в последних нет зарядов на атомах).
Создаются xyz-файлы с координатами атомов и критических точек. 
На экран печатается номер крит. точки в xyz-файле и информация о ней.
Обозначения критических точек можно задать свои, см. в начале скрипта, 
например, NACP и NNACP - XX; BCP, RCP и CCP - He. Сейчас все XX.
По умолчанию критические точки на всех ядрах (NACP) и между связями (BCP), 
которые нарисует молден, не включаются. С опциями -NACP и -all_BCP включаются.
Пятой колонкой в xyz-файле идут для атомов заряды q(A) и для критических точек 
элекронная плотность Rho (их можно посмотреть в молдене Label - atom+charge).