Лаборатория изучения механизмов органических реакций

mldn-gif

Usage: mldn-gif [options] IRC.xyz mol*.gif

Dependencies: Perl, gnuplot, Image Magick

С помощью gnuplot и composite (Image Magick) добавляет график 
координата-энергия на молденовские гифы.

Молден можно запускать без логотипа и лучше с геометрией 4х3.
По умолчанию создается не больше 99 картинок, это можно исправить опцией -j. 
molden -l -geom 800x600 -j 300.
Молден обычно создает одну лишннюю картинку, ее нужно удалить 
(обычно 1-я и 2-я идентичны).

Каждой точке конкатенированного IRC.xyz должен соответствовать свой gif.
В файле IRC.xyz должны присутствовать строки типа 'Energy -54.59304'
(ккординаты и все другое, в принципе, не обязательно).

Опции:
-p <position>  где <position> - положение графика относительно картинки
   t сверху (default)
   b снизу
   r справа
   l слева
   1 в 1-й четверти (сверху слева)
   2 во 2-й (сверху справа)
   3 в 3-й (снизу слева)
   4 в 4-й (снизу справа)
   5 в верхней четверти
   6 в нижней четверти
-f сложить график вдвое (fold up) по вертикали

Некоторые параметры (цвета, например) заданы в начале скрипта, их легко изменить