|
pri2mol
Usage: pri2mol file [files]
Dependencies: perl
Этот перл-скрипт читает выдачи
квантово-химической программы ПРИРОДА (автор Д.Н. Лайков) и делает файлы,
понятные molden'у и заготовки для следующего расчета.
Проверенные версии ПРИРОДЫ: p210, p407, p6, p11 (linux), p202 (Windows).
Создаются следующие файлы:
file.xyz декартовы координаты с зарядами для всех шагов оптимизации
или для каждой точки irc;
file.mos собственные вектора (орбитали) в формате molden'а
(почему-то обрабатываются molden'ом очень медленно);
file.freq колебания в формате molden'а
(при task=hessian);
file.MOL оптимизированная геометрия и гессиан,
которые можно вставить в след. расчет (не для molden'а);
file.ppm хим. сдвиги (sigma и, если посчитан стандарт, то и delta)
(не для molden'а);
file.xyzppm геометрия для molden'а, с хим. сдвигами (delta) вместо зарядов
(molden желательно немного переделать, чтобы он понимал
трехзначные "заряды" (знаю, как)).
Последняя модификация: Mon Aug 15 12:54:47 2022
Download
Source
|